Phaseolus polytene chromosomes

Cytogenetische Karte

Für die Lagebeschreibung der Signale der FISH mußten einige Chromosomenabschnitte künstlich weiter werden, auch ohne daß eine Helligkeits-, Farb- oder Strukturdifferenzierung vorlag. Diese zusätzliche Untergliederung wird durch einen Punkt und eine "gestrichene" Zahl (1', 2' oder 3') nach der Positionsnummer gekennzeichnet. Dabei steht "1'" für das proximale, "2'" für das zentrale und "3'" für das distale Segment. So beschreibt beispielsweise Aq11.2' das zentrale Segment des Abschnitts Aq11.

Um einen Überblick über die Position der FISH-Signale der verschiedenen Sonden zu geben, wurden die Loci in der Tabelle zusammengefaßt. Darüber hinaus wurden die Loci in eine erste cytogenetische Karte der Polytänchromosomen aus dem Embryosuspensor von Phaseolus coccineus eingetragen. Von den insgesamt 57 Loci der Mikrosatellitenmotive, liegen 25 Loci (von 10 Motiven) in euchromatischen Chromosomenabschnitten und 32 Loci (von 10 Motiven) in heterochromatischen. Signale in der NOR wurden nicht berücksichtigt. Loci im Heterochromatin sind unterschrichen. DNC = dichtes nukleoläres Chromatin. * Bereich des kondensierten Chromatins der NOR (=DNC)

DNA-Sonden Loci der FISH-Signale
18S-25S Ap2,Iq3, Kp2
5S Iq12,Kq25
Phaseolin Gp21.3'
(AT)8 Aq21.2', Aq31, Bq21, Bqter, Hq21
(AG)8 Aq21.3',Aq31, Bp21.2', Bq21, Bq31.2',
Cp12, Cq21, Cq31.2',Kq22-23
(CA)8 Ap2*, Bq21, Bpter, Iq3*, Kp2*
(AAT)5 Aq21.2',Aq21.3', Bq21
(AAG)5 Aq32,Bp21.1', Bq21, Bq31.1', Ip22, Kq22
(CAC)5 Ap2*,Iq3*, Kp2*
(AATG)4 cHC aller Chromosomen u. DNC
(GATA)4 Aq21.1',Aq21.3', Bq21
(GACA)4 Aq21.3',Bq21
(C)16 Aq32,Bp21.1', Bq31.1', Ip31, Jp22-24, Jq22-23,
Hp11-12,Hq11, Hq22-24
(GC)8 Kq31.3'
(GCC)5 Aq31, Bp21.2', Bq21, Cp12, Cq21-22, Kq22
Telomer-Sequenz p/qter aller Chromosomen
M13 Konsensus-Sequenz cHC aller Chromosomen u. DNC
33bp repeat Konsensus-Sequenz p/qter aller Chromosomen

12.10.2024 8:27  Phaseolus polytene chromosomes by Mario Nenno. © 2008- Alle Rechte vorbehalten.
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