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3.5.5 Basenzusammensetzung der cHC-Bereiche

Anhand der Hybridisierungssignale verschiedener Mikrosatelliten-Motive im cHC-Bereich wurde auf mögliche Unterschiede in der Basenzusammensetzung zwischen den starken DAPI-Banden und dem restlichen cHC geschlossen. Dazu wurden die verwendeten Oligonukleotide nach ihrem prozentualen Gehalt an Adenin und Tymidin (AT) bzw. Guanin und Cytosin (GC) in drei Gruppen eingeteilt (Tabelle 10).

Tabelle 10: Liste der Oligonukleotid-Sonden eingeteilt nach ihrem Gehalt an AT bzw. GC.

AT-reich(75-100%)

AT - GC (50 -60%)

GC-reich(67-100%)

(AT)8 (100%)
(AAT)5 (100%)
(AATG)4 (75%)
(GATA)4 (75%)

(AG)8 (50%)
(CA)8 (50%)
(GACA)4 (50%)
(AAG)5 (60% A)

(CAC)5 (67% C)
(C)16 (100%)
(GC)8 (100%)
(GCC)5 (100%)

Anschließend wurde das Vorkommen der Oligonukleotid-Sonden im Bereichen der starken DAPI-Bande bzw. dem restlichen cHC-Bereich getrennt nach den zuvor benannten Gruppen bestimmt (Tabelle 11). Dabei wird ersichtlich, daß in den starken DAPI-Banden eine größere Zahl von AT-reichen Mikrosatelliten (15 statt 11) hybridisierten und eine erheblich geringere an GC-reichen Motiven (2 statt 6) als in den restlichen Abschnitten des cHC.

Tabelle 11: Verteilung der Signale von Mikrosatelliten-Motiven im centromerischen Heterochromatin, getrennt nach ihrem Auftreten in den starken DAPI-Banden bzw. in den übrigen Abschnitten des cHC.

Signale
in starken DAPI-Banden

Signale
im restlichen cHC

Chr.

AT-reich

AT - GC

GC-reich

AT-reich

AT - GC

GC-reich

A

(AATG)4

-

-

(AATG)4

-

-

B

(AATG)4,
(AT)8,
(AAT)5,
(GATA)4

(AG)8,
(CA)8,
(GACA)4

(GCC)5

(AATG)4

(AG)8

-

C

(AATG)4

(AG)8

(GCC)5

(AATG)4

-

(GCC)5

D

(AATG)4

-

-

(AATG)4

-

-

E

(AATG)4

-

-

(AATG)4

-

-

F

(AATG)4

-

-

(AATG)4

-

-

G

(AATG)4

-

-

(AATG)4

-

-

H

(AATG)4,
(AT)8

-

-

(AATG)4

-

(C)16, (C)16

I

(AATG)4

-

-

(AATG)4

(AAG)5

-

J

(AATG)4

-

-

(AATG)4

-

(C)16, (C)16

K

(AATG)4

(AG)8

-

(AATG)4

(AG)8, (AAG)5

(GCC)5

15

5

2

11

4

6


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